Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ophn1Q99J31 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ophn1Q99J31 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms