Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms