Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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PdgfdQ925I7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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PdgfdQ925I7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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PdgfdQ925I7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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PdgfdQ925I7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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PdgfdQ925I7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfdQ925I7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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