Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms