Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd1Q923L3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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