Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim59Q922Y2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms