Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf3Q922U1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms