Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi2Q920Q6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms