Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncbQ91ZZ3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncbQ91ZZ3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncbQ91ZZ3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncbQ91ZZ3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncbQ91ZZ3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncbQ91ZZ3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncbQ91ZZ3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncbQ91ZZ3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncbQ91ZZ3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncbQ91ZZ3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncbQ91ZZ3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncbQ91ZZ3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncbQ91ZZ3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncbQ91ZZ3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncbQ91ZZ3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms