Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD3

Tm4sf4, Transmembrane 4 L6 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf4Q91XD3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm4sf4Q91XD3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm4sf4Q91XD3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms