Protein–RNA interactions for Protein: Q91WV7

Slc3a1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc3a1Q91WV7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc3a1Q91WV7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms