Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms