Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd3Q91W18 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms