Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NifkQ91VE6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms