Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Capn8Q91VA3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms