Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cacng8Q8VHW2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacng8Q8VHW2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms