Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cabp4Q8VHC5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms