Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms