Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps4aQ8VEJ9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms