Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fyco1Q8VDC1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms