Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.6 ms