Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn4Q8VCH8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms