Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GcaQ8VC88 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms