Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpm8Q8R4D5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpm8Q8R4D5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpm8Q8R4D5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpm8Q8R4D5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpm8Q8R4D5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpm8Q8R4D5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpm8Q8R4D5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpm8Q8R4D5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpm8Q8R4D5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpm8Q8R4D5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpm8Q8R4D5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpm8Q8R4D5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpm8Q8R4D5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpm8Q8R4D5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpm8Q8R4D5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpm8Q8R4D5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpm8Q8R4D5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpm8Q8R4D5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpm8Q8R4D5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms