Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms