Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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