Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms