Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf3Q8K268 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms