Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sde2Q8K1J5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sde2Q8K1J5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms