Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx5Q8K1E0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms