Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnppd1Q8K158 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms