Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot3Q8K0V4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot3Q8K0V4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms