Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E3

Slc5a11, Sodium/myo-inositol cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a11Q8K0E3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a11Q8K0E3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms