Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Afg3l2Q8JZQ2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms