Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgefQ8CHT1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NgefQ8CHT1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms