Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHG3

Gcc2, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc2Q8CHG3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gcc2Q8CHG3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcc2Q8CHG3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms