Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ercc8Q8CFD5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ercc8Q8CFD5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ercc8Q8CFD5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ercc8Q8CFD5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ercc8Q8CFD5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ercc8Q8CFD5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ercc8Q8CFD5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms