Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkiras1Q8CEC5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms