Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE96

Trmt6, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase non-catalytic subunit TRM6, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt6Q8CE96 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trmt6Q8CE96 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trmt6Q8CE96 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trmt6Q8CE96 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trmt6Q8CE96 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trmt6Q8CE96 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trmt6Q8CE96 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trmt6Q8CE96 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trmt6Q8CE96 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trmt6Q8CE96 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trmt6Q8CE96 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt6Q8CE96 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trmt6Q8CE96 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trmt6Q8CE96 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trmt6Q8CE96 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt6Q8CE96 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt6Q8CE96 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt6Q8CE96 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trmt6Q8CE96 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trmt6Q8CE96 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trmt6Q8CE96 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trmt6Q8CE96 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt6Q8CE96 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trmt6Q8CE96 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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