Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CcinQ8CDE2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms