Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb2Q8CC27 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms