Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb1Q8CBF3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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