Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aph1bQ8C7N7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Aph1bQ8C7N7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Aph1bQ8C7N7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Aph1bQ8C7N7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Aph1bQ8C7N7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1bQ8C7N7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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