Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms