Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ssuh2Q8C3L1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ssuh2Q8C3L1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ssuh2Q8C3L1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ssuh2Q8C3L1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ssuh2Q8C3L1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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