Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms