Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm21394-202ENSMUST00000189463 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm20806-202ENSMUST00000190349 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Aebp2-205ENSMUST00000160836 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim35Q8C006 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Trim35Q8C006 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Gm29436-202ENSMUST00000189054 1172 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms