Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp5Q8BX09 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms