Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Usp38Q8BW70 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Usp38Q8BW70 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Usp38Q8BW70 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Usp38Q8BW70 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Usp38Q8BW70 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Usp38Q8BW70 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Usp38Q8BW70 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Usp38Q8BW70 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Usp38Q8BW70 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Usp38Q8BW70 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Usp38Q8BW70 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Usp38Q8BW70 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Usp38Q8BW70 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Usp38Q8BW70 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms