Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops7bQ8BV13 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops7bQ8BV13 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops7bQ8BV13 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops7bQ8BV13 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops7bQ8BV13 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops7bQ8BV13 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops7bQ8BV13 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops7bQ8BV13 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops7bQ8BV13 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops7bQ8BV13 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms